Осторожно спойлер:
Посередине киносюжета «Жемчужные зёрна» оказывается Анна, молодая женщина, которая разыскивает старую фотокарточку в подвале своего дома. Эта находка становится отправной точкой для её путешествия в прошлое. Незадолго до этого она начинает расследование пропадания своей матери, которое произошло, кажется, много лет назад. Арена - маленький город, где жизнь кажется спокойной, однако вскоре Анна сталкивается с тем, что под поверхностью скрываются мрачные тайны.
Анна начинает расспрашивать местных жителей, но сталкивается с настороженностью и неприязнью. Каждое новое открытие лишь подогревает её любопытство. Она встречает сыщика Петрова, который также был вовлечён в дело о пропаже её матери. Их беседа в ночном баре под дождём раскрывает много неожиданных подробностей, но в то же время ставит перед Анной новые вопросы. Она понимает, что её мать не была той, кем казалась. Однако в её жизни появляются таинственные персонажи, которые мешают её поискам и вносят ещё больше путаницы.
По мере развития сюжета Анна осознаёт, что её расследование запутывается в сети лжи и недомолвок. Она сталкивается с опасностями, которые угрожают не только её жизни, но и жизни её близких. Каждое новое открытие усложняет ситуацию, и Анна вынуждена принимать трудные решения. В ходе поиска истинных ответов она открывает в себе силы, о которых не подозревала, и начинает понимать, что правду иногда труднее принять, чем жить с иллюзиями.